Au niveau recherche je suis intéressé par l’instrumentation pour manipuler/visualiser des molécules individuelles pour étudier des molécules biologiques et leur activité en temps réel. Depuis mon travail de thèse je suis habitué à interagir avec biologistes et chimistes autour des questions du vivant. Pratique que j’essaye de maintenir dans mes activités d’enseignement.
Nous utilisons la réponse mécanique des molécules et la physique statistique pour obtenir des informations sur les interactions entre biomolécules (ADN/ADN, ADN/protéines,…) et l’activité de certaines enzymes qui agissent comme des moteurs moléculaires.
Pour cette approche expérimentale nous développons des méthodes de micromanipulations ou de visualisation pour étudier des objets en relation avec le vivant.
1. Rieu, M. et al. Parallel, linear, and subnanometric 3D tracking of microparticles with Stereo Darkfield Interferometry. Sci. Adv. 7, eabe3902 (2021).
2. Bizard, A. H. et al. PICH and TOP3A cooperate to induce positive DNA supercoiling. Nat. Struct. Mol. Biol. 26, 267–274 (2019).
3. Ding, F. et al. Single-molecule mechanical identification and sequencing. Nat. Methods 9, 367-U74 (2012).
4. Saleh, O. A., Bigot, S., Barre, F.-X. & Allemand, J.-F. Analysis of DNA supercoil induction by FtsK indicates translocation without groove-tracking. Nat. Struct. Mol. Biol. 12, 436–440 (2005).
5. Cogne-Laage, E. et al. Diaroyl(methanato)boron difluoride compounds as medium-sensitive two-photon fluorescent probes. Chem.- Eur. J. 10, 1445–1455 (2004).
6. Allemand, J. F., Bensimon, D., Lavery, R. & Croquette, V. Stretched and overwound DNA forms a Pauling-like structure with exposed bases. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 95, 14152–14157 (1998).